Çene eklemi rahatsızlıkları, genellikle tek bir nedene bağlı olarak değil, çeşitli etkenlerin bir araya gelmesiyle ortaya çıkar. En sık karşılaşılan nedenlerin başında diş sıkma ve gıcırdatma (bruksizm) gelir. Bunun yanı sıra, çeneye alınan travmalar, dişlerin yanlış kapanması, çene yapısındaki bozukluklar, stres, anksiyete ve bazı romatizmal hastalıklar da bu rahatsızlıkları tetikleyebilir.