Ağız yaraları, genellikle stres, bağışıklık sistemi zayıflığı, hormonal değişiklikler veya ağız hijyenine yetersiz özen gösterme gibi faktörlerden kaynaklanır. Ayrıca, diş protezi veya keskin kenarlı diş aletleri gibi dış etkenler de ağız yaralarına yol açabilir. Bazı yaraların ise herpes simplex virüsü (uçuk), aftöz stomatit veya fungal enfeksiyonlar gibi viral veya mantar enfeksiyonlarından kaynaklandığı bilinmektedir.