Es gibt viele Faktoren, die das Gleichgewicht des Mundmikrobioms stören können. Übermäßiger Zuckerkonsum, Antibiotikaeinnahme, Rauchen, unzureichende Mundhygiene, Stress und Mundtrockenheit können zu einer Störung dieses Gleichgewichts führen. Insbesondere eine zuckerhaltige Ernährung erhöht das Kariesrisiko, da sie ein günstiges Umfeld für die Vermehrung schädlicher Bakterien schafft. Ebenso nimmt bei Menschen, die unter ständigem Mundtrockenheit leiden, die Speichelproduktion ab und die natürliche Reinigungswirkung des Speichels wird geschwächt, was zu einer vollständigen Veränderung der Flora führen kann.